Кафедра активно занимается научной деятельностью, ведет хоздоговорную работу, принимает активное участие в различных научно-исследовательских проектах, конференциях, семинарах, как общероссийского, так и международного уровня, выпускает сборники научных трудов.

На базе кафедры успешно ведутся курсы повышения квалификации для работников промышленного транспорта, которые получили высокую оценку у ведущих предприятий области и профильных университетов страны.

Сотрудники кафедры и студенты специальности пишут научные статьи и доклады по проблемам транспортного комплекса страны, её регионов и промышленных предприятий.

Научная школа кафедры организации перевозок Липецкого государственного технического университета сформировалась в 1997 году на базе системного подхода к исследованию взаимодействия производства и транспорта на примерах крупных металлургических комбинатов и магистрального железнодорожного транспорта под руководством заведующего кафедрой, кандидата технических наук, доцента Попова Алексея Тимофеевича, соавтора учебника «Экономика и организация промышленного транспорта», автора более 120 научных статей, 28 методических изданий, редактора двух международных сборников научных статей, автора 6 монографий, руководителя аспирантуры по специальности «Управление процессами перевозок».

В научных транспортных кругах она известна как «Липецкая транспортная школа», полное официальное наименование «Исследование свойств эмерджентности и повышение синергетического эффекта в системах «производство-транспорт-потребление».

Идеологической основой школы является экономико-математическое моделирование транспортно-производственных процессов с использованием аппарата линейного программирования в динамической постановке, имитационного моделирования, теории вероятности и математической статистики, системного подхода к взаимодействию структуры и функций сложных промышленно-транспортных объектов.

Приоритетом школы является решение задач по критерию максимума совокупного дохода и совместных прибылей, разработка методик расчетов для количественного измерения синергетического эффекта от создания систем на основе двухсторонних саморегулирующихся связей.